Marta Szachniuk
| Data i miejsce urodzenia |
9 lutego 1974 |
|---|---|
| Profesor nauk inżynieryjno-technicznych | |
| Specjalność: bioinformatyka, algorytmika | |
| Alma Mater | |
| Doktorat |
2005 – informatyka |
| Habilitacja |
2015 – informatyka |
| Profesura |
2020 |
| Pracownik naukowy | |
| Uczelnia |
Politechnika Poznańska |
| Okres zatrudn. |
1999 - nadal |
| Instytut | |
| Okres zatrudn. |
2003 - nadal |
| Odznaczenia | |
 | |
Marta Xymena Szachniuk (ur. 9 lutego 1974 w Poznaniu[1]) – polska inżynier informatyk i bioinformatyk, profesor nauk inżynieryjno-technicznych. Specjalizuje się w algorytmice, kombinatorycznych problemach biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. Jest profesorem i kierownikiem Zakładu Bioinformatyki Strukturalnej w poznańskim Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN[2] oraz profesorem w Instytucie Informatyki Wydziału Informatyki i Telekomunikacji Politechniki Poznańskiej[3][4]. Kieruje Laboratorium Bioinformatyki RNA w Europejskim Centrum Bioinformatyki i Genomiki[1].
Życiorys
W roku 1993 ukończyła I Liceum Ogólnokształcące im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu. Studiowała na Politechnice Poznańskiej, gdzie w 1998 ukończyła studia magisterskie z informatyki na Wydziale Elektrycznym, a w 1999 - z matematyki na Wydziale Budowy Maszyn i Zarządzania. Stopień doktora nauk technicznych uzyskała na Wydziale Informatyki i Zarządzania PP w 2005 na podstawie rozprawy pt. Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego cząsteczek RNA, przygotowanej pod kierunkiem prof. Jacka Błażewicza. Habilitowała się w 2015 r. na podstawie pracy pt. Informatyczne aspekty opartej na NMR analizy struktur RNA. Tytuł profesora nauk inżynieryjno-technicznych został jej nadany w 2020[3]. W latach 2011–2022 pełniła funkcję wiceprezes Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego[1]. W okresie 2009–2015 była członkinią Zarządu, zaś od 2016 r. jest wiceszefową EURO CBBM (ang. EURO Working Group on Operations Research in Computational Biology, Bioinformatics and Medicine)[1]. W latach 2005–2007 należała do IEEE Computational Intelligence Society oraz IEEE Women in Engineering[1]. Zasiada w Radzie Kuratorów Wydziału IV Nauk Technicznych PAN oraz w Sekcji Nauk Obliczeniowych, Bio i Neuroinformatyki Komitetu Informatyki PAN[1].
Dorobek naukowy
Specjalizuje się w algorytmice, biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. W ramach badań rozwija wraz ze współpracownikami metody obliczeniowe służące do modelowania oraz analizy drugo- i trzeciorzędowej struktury RNA. Rezultatem tych prac jest m.in. platforma RNApolis, obejmująca zestaw narzędzi bioinformatycznych związanych z badaniem struktury RNA[2][5], wśród nich cieszący się bardzo dużym zainteresowaniem na świecie serwer RNAComposer umożliwiający automatyczne modelowanie struktur RNA na podstawie sekwencji nukleotydów[6][7]. Jest autorką artykułów naukowych w wysoko notowanych czasopismach naukowych[8], m.in. w Nature Methods, Bioinformatics, Nucleic Acids Research, RNA i PLoS Computational Biology[9][10][11]. Zasiada w radzie redakcyjnej czasopisma Nucleic Acids Research[12].
Nagrody i wyróżnienia
W 2006 otrzymała prestiżową nagrodę EDDA (EURO Doctoral Disseration Award) za najlepszą w Europie rozprawę doktorską w dziedzinie badań operacyjnych przyznaną przez ang. The Association of European Operational Research Societies (EURO)[1].
Za prace nad metodami rozpoznawania i modelowania struktur 3D RNA otrzymała w 2017 r. nagrodę naukową Wydziału IV Nauk Technicznych PAN[13].
W 2023 r. otrzymała Brązowy Krzyż Zasługi[14].
Kierowane projekty badawcze
- 2017–2020: kierownik grantu NCN OPUS 12 „RNApolis – metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA”[15]
- 2020–2023: kierownik grantu NCN OPUS 18 „Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów”[16]
- 2021–2025: kierownik grantu NCN PRELUDIUM BIS 2 „Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych”[17]
- 2025–2028: kierownik grantu NCN OPUS 27 „Modelowanie struktury RNA ukierunkowane na motywy funkcjonalne”
Przypisy
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Marta Szachniuk CV. cs.put.poznan.pl. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- 1 2 Zakład Bioinformatyki Strukturalnej [online], ICHB PAN [dostęp 2021-01-25] [zarchiwizowane z adresu 2021-01-21].
- 1 2 Prof. dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk, [w:] baza „Ludzie nauki” portalu Nauka Polska (OPI PIB) [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Pracownicy / dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk. Wydział Informatyki Politechniki Poznańskiej. [dostęp 2020-07-16]. [zarchiwizowane z tego adresu (2016-06-30)].
- ↑ RNApolis [online], Rnapolis.pl [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Ludwika Tomala, RNA w 3D? Polacy zostawiają konkurencję w tyle!, [w:] Nauka w Polsce [online], PAP, 10 stycznia 2018 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ RNAComposer [online], ICHB PAN [dostęp 2020-07-16] (ang.).
- ↑ Wykaz czasopism naukowych i recenzowanych materiałów z konferencji międzynarodowych wraz z przypisaną liczbą punktów [online], Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego, 20 grudnia 2019 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Marta Szachniuk (publikacje i cytowania). scholar.google.pl. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Marta Szachniuk. publons.com. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Marta Xymena Szachniuk. researchgate.net. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Editorial Board of Nucleic Acids Research [online] [dostęp 2025-03-28].
- ↑ Przyznano tegoroczne Nagrody Wydziałowe PAN [online], Polska Akademia Nauk, 15 grudnia 2017 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Postanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 10 października 2023 r. nr rej. 404/2023 o nadaniu odznaczeń (M.P. z 2023 r. poz. 1291).
- ↑ RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA [online], NCN [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów [online], NCN [dostęp 2024-02-29].
- ↑ Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych [online], NCN [dostęp 2024-02-29].
Linki zewnętrzne
- Marta Szachniuk (strona domowa). Wydział Informatyki Politechniki Poznańskiej. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).